Во время написания слова "не(?)доначислено" мы сможем заметить, что от контекста, в котором найдено данное страдательное причастие (дополнительно читайте: На какие вопросы отвечают полные и краткие формы причастий), зависят семантические функции данного слова. От них, в свою очередь, зависит и тип написания, выбор которого будет постоянно колебаться между слитным и раздельным.
Если мы видим, что причастие "недоначислено" означает в данном предложении "начислено в недостаточном количестве, в недостаточной сумме, слишком мало, не полностью" и лексически связано с глаголами "начислить" и "недоначислить", то само причастие будет написано в одно слово. Приставка "недо-" присоединена к причастию "начислено".
Если в предложении при помощи причастия отрицается доначисление, говорится о том, что никакого дополнительного начисления не происходило, то уместен будет орфографический вариант "не доначислено" (в два слова). Приставки "недо-" нет, речь об отсутствии доначисления.
Полные правила правописания причастий (полных и кратких форм) с частицей "не" можно прочитать здесь.
Примеры употребления:
"Начисление уже произошло, но то, что было по ошибке недоначислено, мы доначислим вам чуть позже".
"Если что-то снова не доначислено, попросите всё пересчитать и доначислить повторно".