Устойчивое сочетание "вероятнее всего" подвергается или не подвергается выделению запятыми по простейшему пунктуационному принципу, согласно которому знаки препинания требуются в случае функционирования данного сочетания как вводного. И нам остаётся, проанализировав любое из предложений, в котором есть сочетание "вероятнее всего", понять, относится ли оно в данном случае к каким-либо членам предложения или нет.
В частности, если "вероятнее всего" обозначает в контексте гипотезу автора, заменяется словом "наверное", сочетанием "скорее всего", то его можно как бы вычеркнуть, при этом не изменяя существенно семантики текста. Это говорит о вводности. Нужны запятые (Тут можно посмотреть полный список вводных слов в русском языке).
Если сочетание "вероятнее всего" не исключается из предложения и имеет лексическое значение "наиболее вероятен (вероятно, вероятна, вероятны)", то запятые не ставятся, потому что "вероятнее всего", следовательно, вводным сочетанием в таких случаях не является.
Читайте по теме: Список ложных вводных слов, которые при всем желании не следует выделять запятыми, можно увидеть тут.
Примеры употребления:
"Мы сегодня, вероятнее всего, выработаем иную методику".
"Это было вероятнее всего остального, поэтому и произошло". Как видим, "вероятнее всего" по всей логике не является вводным оборотом и не выделяется.