Когда говорят об устойчивом сочетании "в том числе", то имеют в виду, как правило, некий присоединительный элемент в предложении. Его можно назвать союзом. Следовательно, когда речь идёт об обособлении сочетания "в том числе", то не нужно думать, что именно данный присоединительный союз может быть "виноват" в том, что где-то неподалёку от него могут в высказывании появляться запятые.
В сочетании с союзом "в том числе" есть, как правило, целый уточняющий оборот, который способен разъяснять или дополнять что-либо сказанное где-то ранее.
В частности, при помощи союза "в том числе" может присоединяться к остальному высказыванию данный оборот, который содержит в себе уточняющую, дополнительную, объясняющую информацию, которая в более сжатом виде в первой части предложения уже была указана.
Если происходит именно так, то весь указанный нами оборот как бы отделяется запятой от всего, что есть в предложении до него.
Если такой оборот с "в том числе" расположен где-то в середине предложения, то он из-за этого обосабливается запятыми с обеих сторон. Иными словами, где бы этот оборот в предложении ни находился, запятые будут располагаться так, чтобы отделить обособляемое от остального.
Обратим своё внимание на один достаточно важный момент. Случается, что союз, о котором мы говорим ("в том числе") употребляется в своеобразной связке с каким-то другим союзом. Например, с "а" или с "и". Тогда этот "двухсоюзный" тандем пунктуационно считается чем-то целым, союзы, входящие в него, друг от друга никакими знаками препинания не отделяются. Запятая (очень редко - иной знак препинания) ставится исключительно перед первым союзом.
Читайте по теме: Список вводных слов, которые всегда выделяются запятыми, смотрите здесь. Список ложных вводных слов, которые при всем желании не следует выделять запятыми, можно увидеть тут.
Примеры предложений:
Меня поздравили друзья, в том числе и из Кубы.
Все соседи, и в том числе Катя, были на даче.