Структура самого высказывания (то есть предложения), в котором непосредственно используется слово "не(?)рационально", должна нам подсказывать, какой из двух (слитный или раздельный) вариантов написания необходимо признавать правильным.
Во-первых, отметим, что слово "не(?)рационально", морфологическая принадлежность которого колеблется в различных речевых ситуациях от краткого прилагательного до наречия, пишется по-разному, но вне зависимости от этого. Перед словом "рационально" после "не", в принципе, можно будет всегда поместить ещё одно слово: "не очень рационально", "не совсем рационально". Следовательно, определять и анализировать в каждом из случаев часть речи нет необходимости.
Во-вторых, у наречия-прилагательного "не(?)рационально" существует так называемое словарное (стандартное) написание, которое является слитным. Условия, в которых такое написание является правильным, называют обычными или неосложнёнными.
Если же синтаксические условия, в которые попадает слово "не(?)рационально", признаются осложнёнными из-за присутствующего в высказывании противопоставления (например: "не рационально, а бессмысленно", "не рационально, а бесполезно") или любого другого отрицания признака рациональности (например: "вовсе не рационально"), написание окажется раздельным.
Примеры предложений:
"Нерационально то, что мы затрачиваем в полтора раза больше материалов".
"Вы делаете это не рационально, а попусту".
"Предложение ваше ничуть не рационально".