Деревья внутри высказываний всегда со строчной буквы согласно правилу написания нарицательных имен: береза, осина, липа, ель.
В Ботаническом саду университета много редких пород деревьев и кустарников: тополей, осин и можжевельника.
В начале предложения названия деревьев пишем с большой, если они – первые слова:
Береза – символ русской красы.
Имена нарицательные береза, осина, липа, ель и т.п., если становятся названием объекта, пишутся в кавычках и с заглавной буквы:
Ансамбль народного танца «Березка» гастролирует по стране.