Правильно всегда писать слово «попало» раздельно с «не».
Слово «попало» - это глагол, который образуется слово «попасть». По правилам русского языка только глаголы исключения пишутся с «не» слитно, например, недолюбливать, невзлюбить и т.п. А вот остальные глаголы пишут раздельно с «не» и наше слово не относится к списку исключений, поэтому с «не» оно и пишется раздельно.
Примеры предложений.
Мне не попало письмо от твоей подруги, так как его случайно забрал мой брат.
В прошлый раз мне не попало за прогул, надеюсь, в этот раз будет тоже самое.