Видя в предложении устойчивое сочетание "в конце концов", мы можем, в зависимости от смысла всего высказывания, разграничить две одинаково характерных роли словосочетания "в конце концов" в предложении. Запятые будут ставиться по принципу "каково значение, такова и пунктуация".
Если сочетание "в конце концов" выступает в предложении в роли наречного и очень близко по значению к наречиям или наречным словам "в самом конце", "наконец", "напоследок", "после всего", то понятно, что "в конце концов" - это член предложения, не требующий никакого пунктуационного обособления. Такие обстоятельства не выделяются.
Другой случай - это сочетание "в конце концов" в роли вводного. Такая роль данного сочетания видна по характеру всего предложения, которое становится очень эмоционально насыщенным, выражает определённое недовольство, некоторое раздражение говорящего или подчёркивает его нетерпение. В таких высказываниях сочетание "в конце концов" выделяется двумя запятыми (Тут можно посмотреть полный список вводных слов в русском языке).
Читайте по теме: Список ложных вводных слов, которые при всем желании не следует выделять запятыми, можно увидеть тут.
Примеры употребления:
"Интересно, ну когда же, в конце концов, наступит лето?!". Конечные знаки препинания и всё предложение говорят об эмоциональной нетерпеливости высказывающегося. "В конце концов" выделим запятыми.
"Работа в конце концов была успешно выполнена".